DERMATOLOGÍA PERUANA - VOL. 9, SUPLEMENTO 1, DICIEMBRE - 1999


TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR EN El DIAGNÓSTICO EN DERMATOLOGÍA

*GARCÍA-ROJO M1, MORILLO-CASTRO A 2


RESUMEN

La aplicación de las técnicas de biología molecular a las enfermedades de la piel ha permitido conocer los mecanismos íntimos de muchas entidades, facilitando su diagnóstico e incluso su tratamiento. Estas técnicas permiten extraer y analizar el ADN o ARN de sangre periférica o de biopsias de piel, tanto en fresco o en congelación como en los tejidos incluidos en parafina. Las técnicas de hibridación tras la extracción de ácidos nucleicos han evolucionado desde las más sencillas como Southern blot o Dot blot hasta otras más sofisticadas como la hibridación genómica comparada. Sin duda, uno de los campos con más futuro es la aplicación de técnicas de hibridación a las secciones histológicas (hibridación in situ), incluyendo su variación fluorescente para el análisis de cromosomas (FISH, hibridación in situ con fluorescencia). Hoy en día; a mayoría de las técnicas de análisis de ADN se basan en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), que puede ser aplicada a un gran número de procesos nosológicos, y destacar sobre las anteriores por su sensibilidad, aunque a costa de una mayor complejidad tecnológica para impedir falsos positivos. De todas las variantes de PCR, la más destacable es la PCR-transcripción inversa (RTPCR), que permite el estudio del ARNm en las células y por tanto es una herramienta imprescindible para conocer la patogenia en tumores, enfermedades infecciosas (como la detección de micobacterias en biopsias de piel de sarcoidosis), entre otras aplicaciones.

Los métodos utilizados para la detección de mutaciones en el genoma se clasifican según su capacidad para ser utilizados como métodos de cribado como el polimorfismo estructural de cadena simple (SSCP) o la electroforesis en gel desnaturalizante (DDGE), frente a aquellos que detectan mutaciones conocidas, como la amplificación especifica de alelos. Basándose en la estructura especial de algunas regiones del genoma humano, se aplican también técnicas basadas en los llamados microsatélites o telomerasas.

En los próximos años, las técnicas moleculares más eficaces seleccionadas por la experiencia se verán facilitadas por la automatización de cada uno de sus pasos, permitiendo incluso un diagnóstico inmediato en la detección de ciertas mutaciones. Sin embargo, la interpretación de estos datos moleculares es más complicada y debe ser valorada justo con la realidad clinicopatológica de cada paciente.

Palabras clave: Biología molecular, técnicas de diagnóstico

 
SUMMARY

The application of the molecular biology to the skin diseases permit us to know the intimal mechanism of several entities, facilitating its diagnosis and even its treatment. These technics permit us to obtain and analyse the DNA or RNAfrom peripheral blood or skin biopsy, in fresh or frozen and in paraffin tissue.

The hybridization technics after the extraction of nucleic acids had evolved from since the single one like Southern blot o Dot blot to others more sophisticated like comparative genomic hybridization. Undoubtedly one of the fields with more future is the application of hybridizations technics to the histologics sections (hybridization in situ) including its fluorescent variation for the chromosome analysis (Fish, hybridization in situ with fluorescence).

At present most of the technics from DNA analysis are bred on the chain reaction of the polymerase (PCR) which can be applicated to great number of nosologic processes and has the advantage upon the precedents because its sensitivity, although it is more complicated to avoid false positives. From all the variants of PCR the most outstanding is the PCR reversal transcription (RTPCR) which permit to study the RNAm in the cells and for this is a invaluable too) in order to know the pathogenic in tumors, infectious diseases (like byopsal of sarcoidosis) between other applications.

The methods used for the detection of mutations in the genome are , classified according their capacity to be used like cribble method, like the structural polymorphism of single chain (SSCP) or the electrophoreticin denaturalizant gel (DDGE) facing others which find known mutations like the specific amplification of alleles.

Based on the special structure of some regions from the human genome, some technics based on the calls microsatelite or telomerase are also applied.

In the next years the most efficient molecular technics selected by the experience shall be facilited for the automatization of each one of their steps, permitting even a immediately diagnosis in the detection of some mutations.

However the interpretation of these available molecular dates still is complicate and should be considered with the clinic-pathologic presentation in each patient.

Key words: Molecular biology, technics of diagnostic.


Dermatología Peruana 1999; 9(sup. 1): 5-40

 
INTRODUCCIÓN

En los últimos años hemos vivido una transición, aún en marcha, en la aplicación de las técnicas de biología molecular desde los laboratorios de investigación científica hacia los laboratorios de patología o de análisis clínicos de los centros hospitalarios. El resultado ha sido poder disponer de numerosas herramientas que han aumentado el arsenal diagnóstico en las enfermedades de la piel. La gran fuerza de estas técnicas reside en su sensibilidad y especificidad para detectar anomalías a nivel del ADN o ARN, en vez de estudiar sus productos proteicos o expresión clínica o morfológica, con frecuencia variables. De esta forma, podemos llegar a un diagnóstico en ausencia de cambios morfológicos discernibles o cambios en la expresión proteica. Además, con frecuencia es necesaria muy poca cantidad de tejido para obtener resultados.

Las técnicas de biología molecular aún son algo complicadas, su costo es elevado y su eficacia en algunos casos aún está pendiente de ser evaluada. Mientras tanto, las técnicas inmunohistoquímicas son más baratas, menos complicadas y la información morfológica se mantiene (por ello, los datos obtenidos son más familiares para los patólogos) y son de un valor inestimable para el estudio de clonas aisladas de células malignas en el contexto morfológico adecuado.

Hoy en día aceptamos que la mayoría de las enfermedades, ya sean congénitas o adquiridas, tienen una base genética1. Por lo tanto, las técnicas basadas en ADN/ARN son de utilidad en casi todas las áreas de diagnóstico dermatológico, incluyendo procesos neoplásicos, enfermedades infecciosas, condiciones hereditarias y procesos inflamatorios o autoinmunes.

La incidencia del cáncer de piel está aumentando de forma notoria en las últimas décadas, se estima que en Estados Unidos aparecen más de un millón de nuevos casos de cáncer de piel distinto al melanoma cada año2. La radiación UV se ha asociado sobre todo a este tipo de cáncer distinto al melanoma, y el mecanismo de acción está relacionado con la pérdida de la capacidad de las células epidérmicas para controlar la proliferación celular3. Las células tienen mecanismos que contrarrestan este daño antes de que se desarrolle el cáncer e incluyen reparación de ADN, apoptosis y vigilancia inmunológica. La radiación UV puede dañar a las células de la piel mediante la formación de dímeros en el ADN entre residuos de pirimidina adyacentes y puede originar mutaciones que se van acumulando con el tiempo. La célula puede responder a este daño reparando el ADN para evitar mutaciones dañinas o, si el cambio es demasiado grande, induciendo la apoptosis para eliminar la célula potencialmente cancerosa4 Además, la radiación UV parece disminuir las funciones del sistema inmunológico en la piel, creando un ambiente favorable para el desarrollo y crecimiento de tumores5. De hecho, los pacientes inmunodeprimidos tienen un mayor riesgo de desarrollar cáncer de piel no melánico, como sucede en los pacientes sometidos a trasplante renal, que desarrollan un número elevado de carcinomas epidermoides, epiteliomas basocelulares, tumores cutáneos asociados a virus y queratoacantomas, principalmente en piel expuesta a la radiación solar6.

La carcinogénesis por radiación UV se relaciona con la inactivación de genes supresores (p53 y patched) o la sobreexpresión de oncógenos estimuladores del crecimiento (ras). Tabla 1.3

TABLA 1. Genes asociados a tumores cutáneos
Gen Función Localización
- p53 Supresor de tumor, inducción de reparación de ADN y apoptosis. Perinuclear/nuclear
- Patched Supresor de tumor Transmembranoso
- ras(H; K;N) protooncogenes; transducción de señal mediante unión de GTP Membrana celular

A diferencia del carcinoma epidermoide, el epitelioma basocelular parece que surge sin un estadio precanceroso. La genética del melanoma es peor conocida, pero también se asocia a mutaciones por rayos UV7.

Puesto que la mayoría de los tumores malignos aparecen como consecuencia de eventos genéticos adquiridos y son clonales, son muy adecuados para los estudios de biología molecular 8. Aunque históricamente los estudios de diagnóstico molecular han sido más utilizados en neoplasias hematológicas, su aplicación en tumores sólidos, concretamente en neoplasias cutáneas está evolucionando rápidamente en los últimos años. De hecho, el descubrimiento y clonación de genes permite detectar nuevos antígenos, que pueden ser dianas para el tratamiento de tumores malignos, como el gen Meian-A/MART-1 en la inmunoterapia del melanoma9.

 
BIOLOGÍA MOLECULAR EN El DIAGNÓSTICO EN DERMATOLOGÍA

En las enfermedades infecciosas, las pruebas de biología molecular se han utilizado en aspectos diagnósticos, en estudios epidemiológicos y en la identificación de microorganismos previamente desconocidos1.

Las enfermedades hereditarias de la piel se caracterizan por mutaciones genéticas. El diagnóstico molecular está hoy día disponible para múltiples enfermedades, en muchas de las cuales anteriormente apenas se disponía de técnicas diagnósticas. Estas técnicas podemos emplearlas no sólo en el diagnóstico directo de la enfermedad, sino también y predominantemente, en la detección de portadores y en el diagnóstico prenatal. El diagnóstico prenatal se realiza fundamentalmente mediante biopsias de vellosidades coriales, que pueden ser obtenidas en forma segura en el primer trimestre del embarazo, aunque también es posible el diagnóstico preimplantación en casos de fecundación in vitro10.

El diagnóstico molecular de las enfermedades hereditarias ofrece dos ventajas claras. en primer lugar, es notablemente sensible y con frecuencia es suficiente disponer de una sola célula nucleada, en segundo lugar, todas las células del organismo contienen el mismo ADN, lo que conlleva un riesgo elevado de tumores malignos3. En otras enfermedades hereditarias existe una producción proteica defectuosa, frecuentemente en la zona de la membrana basal, como sucede en la epidermólisis ampollosa distrófica y juntural, que se manifiestan clínicamente como fragilidad cutánea y formación de ampollas subepidérmicas originadas por un trauma mínimo11.

En las enfermedades con base inmunológica, la identificación de las principales células y moléculas que intervienen en la iniciación y en el mantenimiento de procesos alérgicos o autoinmunes, probablemente constituirá la base para el tratamiento de este grupo de enfermedades.

En la enfermedad injerto contra huésped, el estudio del quimerismo de los leucocitos permite valorar más detalladamente las causas de neutropenia en enfermos trasplantados, permitiendo un diagnóstico y tratamiento tempranos de la enfermedad injerto contra huésped12.

El análisis del cariotipo (análisis cromosómico) ha sido una herramienta útil en el estudio de tumores y enfermedades congénitas, tanto para definir diferentes entidades como para proporcionar pistas sobre los mecanismos involucrados en su patogenia. Sin embargo, además de ser una técnica laboriosa, conlleva algunos problemas adicionales13.

• La necesidad de disponer tejido en fresco.
• Puede ser necesario el cultivo in vitro del tejido.
• Las células en división pueden no ser representativas de la lesión o tumor.
• Los cromosomas obtenidos pueden ser de mala calidad.

Por ello, han surgido nuevas técnicas que detectan anomalías cromosómicas numéricas y estructurales de una manera más rápida y eficiente. La citogenética de interfase es el análisis de cromosomas en células sin división y es diferente del análisis cromosómico convencional, en que se estudian las mitosis detenidas en metafase.

Figura 1. Un modelo para la inducción de cáncer de piel por radiación UV. Modificado de Soehnge et al.3
(UCA: Acido urocánico)

 

OBTENCIÓN DEL ADN/ARN

La práctica totalidad de las técnicas de biología molecular aplicadas a los tejidos cutáneos se basan en el estudio del ADN o en ocasiones del ARN. Por ello el primer paso para llevar a cabo la mayor parte e estas técnicas implica la obtención de ácidos nucleicos, especialmente ADN, a partir de las muestras de las que disponemos14 Estas técnicas son sencillas pero es importante mantener precauciones para evitar tanto la degradación del material genético por nucleasas (problema especialmente importante en el caso de la extracción de ARN dado que las ARNasas son muy ubicuas)15. como la contaminación de las muestras por ADN ajeno (problema especialmente importante en el caso de la extracción de ADN destinado a la posterior realización de técnicas de PCR ya que la gran sensibilidad de esta técnica para amplificación génica hacen que cualquier contaminación pueda provocar falsos positivos).

En la actualidad existen kits comerciales para obtención de ADN tanto desde sangre como de tejidos o de células, e incluso se puede llevar a cabo esta extracción de forma automatizada16. Es importante destacar que es posible la extracción de ADN de tejidos fijados en formol e incluidos en parafina e incluso de material citológico fijado, en estos casos el material genético probablemente no se encuentre perfectamente conservado aunque aún es útil para la realización de ciertas técnicas como la PCR.


De la sangre o de material citológico obtenido de PAAF (punción aspiración con aguja fina), cultivos o exudados corporales

Se obtiene ADN de las células nucleadas. En el caso de la sangre es suficiente con 10 a 30 mL recogidos sobre EDTA (anticoagulante) para obtener varios cientos de microgramos de ADN en forma de fragmentos de una longitud de hasta 20 kilobases (kb); la cantidad de ADN varia dependiendo de la cantidad de células nucleadas que contenga la muestra. En la extracción se separan las células nucleadas (leucocitos en el caso de la sangre) mediante centrifugación y se usan utilizando una solución que contiene el detergente SDS (dodecilsulfato de sodio) y proteinasa K que libera el ADN al medio y digiere las proteínas. Posteriormente el ADN presente en el sobrenadante se obtiene por precipitación con alcohol etílico absoluto y acetato 17.


De tejidos frescos o conservados en congelación

En primer lugar hay que homogeneizar el tejido (cortándolo en pequeños fragmentos) para facilitar la posterior lisis de las células que lo componen. Después de homogeneizado se incuba en SDS Y proteinasa K y posteriormente se llevan a cabo una serie de extracciones con fenol y cloroformo que tienen como objeto separar las proteínas del ADN.


De tejidos incluidos en parafina

El ADN de estas muestras es estable durante años (el ADN es una molécula muy estable y su estructura molecular es muy difícil de alterar a diferencia del ARN). Se obtiene secciones de tejido que desparafinan y se incuban durante unas horas con SDS y proteinasa K, a partir de aquí se procede igual que con los tejidos congelados. Es necesario tener en cuenta que a veces el ADN genómico tras la inclusión en parafina se encuentra fragmentado, hecho que es necesario tener en cuenta para futuros análisis. Por ejemplo es desaconsejable intentar amplificar mediante PCR fragmentos de ADN de gran longitud partiendo de ADN obtenido de este material. También es importante saber que algunos fijadores (como el Bouin o los mercuriales) degradan el ADN de forma más intensa que el formaldehído, lo que dificulta los estudios sobre material que se ha fijado con ellos (por ejemplo las biopsias de médula ósea)18,19.

TABLA 2. Sensibilidad de las écnicas de biología
Técnica Umbral de detección Tipo de muestra
Hibridación en filtro (Southern blot o slot blot) 1 copia/100 células en fresco
Hibridación in situ 100 copias/célula en fresco o fijado
Reacción en cadena de polimerasa (PCR) 10 copias/tejido en fresco o fijado
PCR hibridación in situ 1 copia/célula fijado
TÉCNICAS DE HIBRIDACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEÍCOS 
HIBRIDACIÓN TRAS LA EXTRACCIÓN DEL ADN

Southern blot

La denominación de esta técnica proviene del nombre del autor que la introdujo en 197520. La técnica consiste en tratar el ADN con enzimas de restricción (enzimas que cortan el ADN por secuencias específicas), tras lo cual se separan los fragmentos mediante electroforesis en un gel de agarosa quedando separados según el tamaño de los fragmentos de ADN. Después de la electroforesis el gel se trata para desnaturalizar el ADN que se transfiere a un filtro de nitrocelulosa o nylon mediante un sistema de vacío, sobre el que se fija con luz ultravioleta ("crosslinker” o calor, una vez tratado el ADN tiene cargas negativas) y por último se expone la membrana a sondas complementarias (hibridación) de la cadena que deseamos buscar marcadas radioactivamente o con digoxigenina-biotina, las sondas quedarán fijadas al fragmento de ADN del que son complementarias lo que nos confirma que el ADN de la banda correspondiente es efectivamente el que buscamos (121).

Aplicación en Dermatología

Southern blot sigue siendo una de las técnicas más fiable en biología molecular, y es empleada para el estudio de reordenamiento, amplificación, deleciones y mutaciones puntuales de genes22.

Esta técnica se ha venido utilizando para la detección de reordenamientos del gen de las inmunoglobulinas en la detección de monoclonalidad del tejido linfoide: si hibridando con una sonda complementaria a parte del gen estructural de las inmunoglobulinas (por ejemplo la sonda JH) se detecta que todos o la mayoría de los fragmentos obtenidos en este área del genoma al fragmentar el ADN son del mismo tamaño, hay que asumir que toda o la mayoría de la población linfoide está reordenando sus genes de inmunoglobulinas de la misma manera lo que implica monoclonalidad. Aunque algo más complicado que por PCR, también puede aplicarse el análisis Southern blot en tejidos incluidos en parafina. Actualmente la PCR ha sustituido al Southern blot en detección de reordenamientos19.

La presencia de translocaciones (como t(2:5) en el linfoma anaplásico) puede ser detectada incluso en tejidos incluido en parafina23.

Aunque ha sido sustituida por otras técnicas, hasta hace pocos años, era el "gold standa” para la detección de HPV y subtipos22

La principal ventaja de Southern blot son sus altas especificidad y reproducibilidad y permitir la valoración del estado físico del ADN, y así poder valorar si el ADN viral está integrado en el genoma del huésped o permanece como episoma en el huésped, Es un método excelente para detectar pérdidas homocigóticas. Las desventajas de Southern blot son que es una técnica de larga duración, que requiere un personal entrenado, y aún así son frecuentes los artefactos y la variabilidad entre laboratorios24. Además, precisade una cantidad relativamente alta de ADN, sólo permite estudiar una pequeña región del genoma con cada sonda y la mayoría de las sondas son poco informativas (heterocigosidad baja)25.


Northern blo

También es posible aplicar la técnica de Southern blot a ARN con algunas modificaciones, denominándose Northern blot, el cual puede ser aplicado a las biopsias de piel, a las que se aplican técnicas de extracción de ARN26. A diferencia del Southern blot, no es necesaria la digestión con enzimas de restricción y, aunque el ARN es una cadena única, su estructura secundaria compleja hace necesario el uso de técnicas de desnaturalización, generalmente con formaldehído y formamida. Así, una vez extraído el ARN se aplica electroforesis en geJes de 1% de agarosa-formaldehído27. El ARN puede ser teñido con colorantes como el naranja de acridina. Posteriormente es transferido a membranas de nylon especiales (Hybond­N+). Estos "blots" son posteriormente hibridizados con sondas de ADN complementario marcado (por ejemplo, con 32P para involucrina). La cantidad del marcador obtenido puede ser medida mediante un densitómetro de láser aplicado al autorradiograma obtenid28.

Aplicación en dermatología

Aunque el northern blot se utiliza para analizar el ARN en el tejido completo, la hibridación in situ es una técnica que permite determinar la expresión de un gen (ARNm) o la presencia del gen en sí (ADN), en células individuales tanto en secciones tisulares como en preparaciones citoiógicas29.

Se ha utilizado para analizar la expresión de ARNm específico de determinadas proteínas, como la estromelisina 3, una proteína que podría jugar un papel significativo en la destrucción de la zona de la membrana basal y en la matriz extracelular en la invasión del epitelioma baso­celular30.

En la acrodermatitis enteropática se ha utilizado Northern blot para caracterizar los gen involucrados, similares a los de la subunidad 11 de citocromo oxidasa y LINE 1 retrotransponsons humano31


Western blot o immunoblot

Asimismo es posible aplicar la electroforesis en gel de poliacrilamida a homogeneizados de proteínas, transferirlas a una membrana y revelarlas con anticuerpos específicos similares a los utilizados en inmunohistoquímica32.

La gran ventaja de este método es que permite reconocer el peso molecular de la proteína en estudio y tiene mayor fiabilidad que otros métodos, aunque no aporta información sobre su localización en el contexto celular y tisular de la lesión21.

Aplicación en Dermatología

En los estudios de carcinogénesis con frecuencia se valora la expresión de algunos genes, como la proteína del retinoblastoma, para conocer el efecto inhibidor de determinadas sustancias. De esta forma, se ha comprobado que algunas sustancias presentes en el té verde, muy consumido en el lejano Oriente, inhiben el crecimiento de células tumorales, reduciendo el nivel de proteína del retinoblastoma, por lo que estas sustancias podrían servir para la quimioprevención del cáncer al impedir la progresión de las lesiones leucoplásicas de la boca33

En los estudios de dermatitis de contacto por irritantes, se emplea Western blot para comprobar una disminución de los niveles de la proteinquinasa C34.

También se emplea en la identificación de anticuerpos circulantes frente a determinados microorganismos, como en la leishmaniasis cutánea.


Hibridación genómica comparativa

Se utiliza para evaluar el número total de aberraciones del genoma de la muestra a analizar basándose en la capacidad del ADN para la hibridación con secuencias homólogas. Se trata de extraer ADN de células normales y de células tumorales tras lo cual se híbrida con células diana normales. Dado que las células diana y el ADN control (extraído de células normales) presentan el mismo ADN (homología 100%) las diferencias al comparar la hibridación control y la de la muestra tumoral se deberán a anomalías presentes en el tumor La valoración cuantitativa de esta diferencia ha de hacerse utilizando un sistema de análisis digital de imágenes21.

Sus ventajas consisten en que permite identificar todo el genoma de las células malignas al mismo tiempo, distin­gue con facilidad regiones de pérdida o de ganancia alélica y necesita cantidades muy pequeñas de ADN. Las desventajas se centran sobre todo en la baja resolución y en no aportar información sobre el origen materno o paterno del alelo25

Aplicación en dermatología

Poco utilizado en general, se ha aplicado al carcinoma epidermoide de cavidad oral, que presenta un patrón de desequilibrio genético distinto al observado en otros carcinomas. De hecho, la diferenciación hacia carcinoma epidermoide en cavidad oral se asocia con ganancias en 3q, 5p, 11q 13 y 19, pero también con pérdidas en 3p, 5q21, 8p y 9p. Sin embargo, este patrón no se confirma en el carcinoma epidermoide fuera de la cavidad oral36.

Las deleciones y las inserciones de material genético en tumores sólidos pueden ser documentadas mediante hibridación genómica comparada o FISH. La primera tiene la ventaja de no precisar de sondas específicas37.


Slot-blot y Dot blot

Consiste en transferir directamente el ADN a la membrana sin haber realizado previamente rotura del ADN ni electroforesis e incubarlo con sondas de ADN complementarias a las secuencias de ADN que buscamos (que contengan las mutaciones que buscamos). En este método cada muestra se coloca en un punto determinado (“dot”)y posteriormente se desnaturaliza para que la hibridación pueda tener luga38.

Existe una variante de esta técnica en la que las sondas de ADN complementarias a la que buscamos ya se encuentran inmovilizadas en el filtro de nylon al que se hace la transferencia y lo que marcamos es el ADN muestra (dot-blot inverso).

La existencia de reactivos comerciales de rápida realización, en los que el revelado puede realizarse con sustancias quimioluminiscentes, ha facilitado la aparición de kits comerciales basados en esta técnica39.

Aplicación en dermatología

Se utilizan poco. Se han usado para detección de mutaciones de la familia ras en tumores. Se utiliza, en general, cuando no es necesario fragmentar por su tamaño el ácido nucleico. Es una técnica adecuada para el estudio de múltiples muestras o la valoración semicuantitativa utilizando diluciones seriadas del ADN de prueba38.

Los kits comerciales basados en hibridación dot blot para el virus del papiloma humano (ViraPap/Vira Type, Laboratorios Digene, EE.UU.) utilizan sondas radioactivas específicas para siete genotipos HPV (HPV 6, 11 16, 18, 31,33 y 35). Su sensibilidad es idéntica a Southern-blot40, aunque menor que los métodos de amplificación que veremos posteriormente41. Estos kits están siendo susti­tuidos por el método de captura hibrídica.


Captura hibrídica. Hibridación en fase de solución

El método captura hibrídica (Laboratorios Digene, EE.UU.) es actualmente el más popular para la detección de infecciones por el HPV Se basa en las técnicas más antiguas de metodología de trabajo con ácidos nucleicos: la hibridación en fase de solución, en la que tanto el ADN diana del HPV como la sonda interaccionan libremente en una solución acuos42. Puede ser aplicada a células descamadas o en muestras de tejidos. Se utiliza dos mezclas de sondas de ARN, una para los genotipos HPV de bajo riesgo: 6,11,42, 43 y 44, y otra para los genotipos HPV de riesgo intermedio/alto: 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59 y 68. Las muestras positivas se detectan uniendo los complejos de la hibridación en tubos revestidos con un anticuerpo monoclonal ligado a fosfatasa alcalina contra híbridos ARN:ADN. Al añadir una sustancia quimioiuminiscente, la emisión de luz puede ser medida en unidades relativas de luz43. La sensibilidad de la prueba se estima en 1000 copias de ADN de HPV-16, algo menos que PCR, pero con una mayor especificidad22.


HIBRIDACIÓN DIRECTA SOBRE CORTES HISTOLÓGICOS O CÉLULAS

Hibridación "in situ"

La técnica permite la localización de secuencias de ácido nucleico, ADN, ARN virales, ARN celular o ADN cromosómico, en el lugar del tejido en el que se encuentra.

La hibridación es de gran valor en estudios genéticos, permitiendo el análisis de la regulación temporal y espacial de la expresión de genes. También se utiliza en el diagnóstico en medicina, para identificar secuencias virales en tejidos y proporcionar información sobre los mecanismos patogénicos de las infecciones viraLes. Asimismo, la hibri­dación in situ puede ser aplicada en el mapeo físico del genoma y en la identificación e interpretación de reordenamientos genéticos44.

La característica que la distingue de otros métodos basados en hibridación -como la hibridación de Filtro y las técnicas de ciclos térmicos (reacción en cadena de la polimerasa (PCR), ligasa de ADN, etc.)- es que el ADN de la muestra no es extraído sino que es detectado directamente en la célula intacta.

Parte de un corte de tejido o de material citológico extendido sobre un porta (preferiblemente tratado con 3­aminopropiltrietoxisilano). En primer lugar la sección o el frotis citológico se trata enzimáticamente con proteinasa K o pronasa o se calienta en microondas, con el fin de romper las envolturas celulares y permitir el acceso de la sonda al núcleo durante la hibridación (lo que no altera la morfología celular), posteriormente, se procede a la desnaturalización del ADN cromosómico por calor (95°C) y posteriormente se añade una solución que contiene la sonda con el ADN o ARN marcado con componentes radioactivos como P32 I125 S35, H3 o componentes no radioactivos como peroxidasa, biotina o digoxigenina complementarios a la secuencia genómica que buscamos 45-48 El marcador empleado (p. El: digoxigenina) es marcado (fosfatasa alcalina) y posteriormente es revelado (fuchsina/haftol-AS-bifosfato49,50.

Los mejores resultados se obtienen en tejidos fijados en formol o en paraformaldehído, y con menor éxito, la hibridación in situ también puede ser aplicada a tejidos congelados o tras fijación en alcohol u otros fijadores coagulantes22.

La sonda para la detección de un fragmento de ARN mediante hibridación in situ puede ser generada mediante RT-PCR utilizando determinado cebadores50.

La hibridación es más sensible, en general, que las técnicas de inmunohistoquímica, pues éstas pueden dar resultados negativos según el grado de síntesis del componente buscado, la degradación intracelular, el transporte intracelular o por procesos postraducción de péptidos que modifiquen la estructura proteica buscada. Sin embargo, la hibridación in situ es menos sensible que las técnicas de hibridación en filtro (Southern blot) y PCR (Tabla 2). Un ejemplo lo tenemos en las lesiones por el virus del papiloma humano (HPV), en el que la infección por HPV oculta, sin evidencia de enfermedad microscópica o microscópica, el número de genomas de HPV en las células escamosas puede ser de uno o de muy pocas copias y, por lo tanto, sólo será detectado mediante Southern blot o PCR44.

La sensibilidad de la hibridación in situ puede ser aumentada utilizando moléculas biotiniladas de tiramida, que amplifican la señal obtenida. Las tiramidas son moléculas que, una vez activadas por una molécula de peroxidasa unida a la sonda de detección, se unen de forma covalente a la proteína más cercana disponible51. Otro método para detectar ADN de HPV cuando está presente en muy pocas copias en tejidos, es la hibridación in situ fluorescente estudiando las señales de hibridación mediante microscopia confocal láser de rastreo, que permite detectar una o dos copias de ADN de HPV por célula52.

La hibridación in situ se utiliza para localizar en el tejido la expresión oncogénica de un componente particular (por ejemplo, detectar el gen Wtl en el tumor de Wilms), para correlacionar el grado de expresión de un oncogén con el grado de atipia citológica, y para correlacionar la detección de ARNm de un oncogén con la proteína de dicho oncogén usando simultáneamente inmunohistoquímica). Además, la hibridación in situ puede realizares no sólo junto con inmunohistoquímica, sino combinada por PCR (PCR in situ) o en microscopia electrónica, utilizando oro coloidal13.

Aplicación en Dermatología

a. Infecciones virales

Se ha aplicado a la detección de ADN de virus como virus del papiloma humano (HPV) especialmente útil para diferenciar subtipos), EBV o CMV permitiendo detectar infecciones productivas y latentes.

Virus del papiloma humano (Tabla 3).

TABLA 3. Lesiones por el virus del papiloma humano (HPV)

Lesión Tipo HPV
Verruga plantar 1
Verruga vulgar 2,4
Verruga plana 3,10,27-29
Verrugas del carnicero 7
Epidermodisplasia verruciforme 1-4,7,9,10,12,14,17-19, otros
Condiloma acuminado 6,11
Papulosis bowenoide 18,21,22-35, otros
Papulomatosis oral (enfermedad de Heck) 8
Quratoacantoma 6,9,11,13,16,18,19,otros

La hibridación in situ ha sido una herramienta esencial para comprender el papel del HPV en las lesiones intraepiteliales escamosas (SILs) del tracto genital inferior53. Los siguientes aspectos han sido determinados gracias a la hibridación in situ:

- El ADN del HPV es más abundante en las células más superficiales que muestran halos perinucleares y atipia nuclear.

- El número de copias del ADN del HPV es mucho mayor en las SILs de balo grado que en las SILs de alto grado o el cáncer invasor

- La diversidad de tipos HPV es mucho mayor en las SILs de cérvix que en las SILs de vulva o de pene. HPVs 6 y 11 son relativamente raros en SLIs de bajo grado de cérvix, y por el contrario son detectados en más del 95% de las lesiones equivalentes de la vulva. El tipo HPVs 6y 11, el más frecuente en cáncer de tracto genital y el más frecuente en lesiones de alto grado, es también el más frecuente en SILs de cérvix, pero rara vez aparece en lesiones de bajo grado vulvares o peneanas44.

Una aplicación práctica es que, a diferencia de las lesiones cervicales (en las que se necesitan más de 14 sondas distintas), podríamos utilizar en sólo sondas para HPV 6, 11 y 16 para el estudio de lesiones en vulva y pene.

Definimos infección oculta por HPV como la presencia del virus en ausencia de evidencia clínica o anatomopatológica de infección. Mediante el empleo de Southern blot, el porcentaje de infección oculta en el tracto genital inferior es de un 10%. Cuando se utiliza PCR, se encuentran tasas de hasta un 30%. La hibridación in situ no es una técnica útil para la detección de infección oculta ni para el estudio en el cáncer invasor, pero es tan eficaz como el Southern blot o la PCR para la detección de ADN de HPV en lesiones de balo grado, en las que nos permite tipificar el HPV44.

En el caso de lesiones vulvares o peneanas difíciles de interpretar en el examen histológico, la tasa de detección de infección por HPV mediante hibridación in situ es de un 8% , frente al 1-2% de lesiones difíciles de interpretar en cérvix44. Esta diferencia probablemente reflela el hecho de cambios citológicos más evidentes en las SILs de cérvix que en las lesiones de vulva o de pene.

Se piensa que el HPV 5 juega un papel importante en la transformación maligna en la epidermodisplasia verruciforme54.

La presencia de HPV permite a su vez realizar el diagnóstico diferencial de verrugas virales con otras lesiones cutáneas como la queratosis seborreica54

- Citomegalovirus (CMV)

Además de órganos profundos (cerebro, riñón, pulmón, etc.) este virus frecuentemente afecta a mucosa (conjuntiva o tracto aerodigestivo). Los cambios citológicos del citomegalovirus son característicos, describiéndose inclusiones eosináfilas intranucleares rodeadas de una zona clara de cromatina periférica en grumos e inclusiones citoplasmáticas basófilas55. La hibridación in situ de estas células muestra una señal de hibridación constantemente intensa, debido a la presencia de cientos o miles de copias de los genomas virales en el núcleo. Sin embargo, con esta técnica se observa muchas más células infectadas por CMV que las apreciadas en el examen morfológico inicial56-58.

- Virus de Epstein-Barr (VEB)

La infección por VEB, un virus ADN miembro de la familia Herperviridae, generalmente causa una seroconversión asintomática o mononucleosis infecciosa. El VEB también está asociado a linfoma de Burkitt, carcinoma nasofaríngeo y a procesos linfoproliferativos en inmunodeficiencias congénitas y adquirida55.

La hibridación in situ es especialmente útil para demostrar la presencia de VEB en infiltrados linfoides. La infección por el virus de Epstein-Barr puede ser determinada mediante hibridación in situ para detectar pequeños fragmentos de ARN del virus (EBER 1 y 2)59,60,61.

Una variación genotípica en el VEB que puede tener significación patogenética es la deleción de 30pb en el gen LMP 1 del VEB, cuya proteína favorece la expresión de diferentes genes celulares e inhibe la apoptosis al inducir a bcl-263.

En la amiloidosis cutánea primaria (liquen amiloideo y amiloidosis maculosa) se ha detectado la presencia del virus de Epstein-Barr (EBERs) en un 40,7% de los casos, aunque el papel etiológico del virus en la amiloidosis cutánea primaria está aún por dilucidar63.

- Virus de inmunodeficiencia humana (VIH-1)

El diagnóstico de infección por VIH generalmente se realiza mediante pruebas serológicas, por Western blot o técnicas de diagnóstico molecular.

Una vez que el virus penetra en una célula, el genoma ARN sirve de molde para la síntesis de una copia de ADN complementario (ADNc) mediante la transcriptasa inversa 64,65. El ARN viral es destruido y el ADN se integra en el genoma humano, donde puede permanecer latente durante años. El virus latente puede no ser detectado mediante hibridación in situ pero puede ser detectado mediante PCR. Sin embargo, cuando el virus "es activado" puede sintetizar muchas copias (más de 50) de su ARN, que entonces pueden ser detectadas mediante hibridación in situ, aunque con frecuencia la infección activa del VIH no puede ser detectada mediante hibridación in situ porque el virus con frecuencia no realiza muchas copias de su ARN64-66. Combinando PCR e hibridación in situ con RT-PCR in situ podemos detectar la infección por VIH-1 in situ y distinguir entre infección latente e infección activa44.

- Virus del herpes simple y zoster

Junto con los estudios inmunohistoquímicos para las glicoproteínas gB, gC y gD del virus del herpes simple, la hibridación in situ permite localizar el virus del herpes simple 1 y 2 y el virus varicela-zoster incluso en las lesiones cutáneas de curso prolongado en las que sólo se identifica un patrón inflamatorio liquenoide y no se observa lesiones cito líticas 67-69.

- Otras infecciones virales

La hibridación in situ es útil para documentar otras infecciones virales donde las características citomorfológicas en el telido no son muy llamativas, como en el adenovirus58. La técnica es especialmente útil cuando se asocian múltiples infecciones virales simultáneamente69.

b. Patología tumoral

La hibridación in situ es un método muy útil para detectar el ARN de hormonas peptídicas, cadenas ligeras o cadenas pesadas de inmunoglobulinas. También permite estudiar la sobreexpresión oncogenes como de N-myco de bcl-2 en linfomas foliculares.

En el epitelioma basocelular de piel, mediante hibridación in situ se ha detectado expresión de estromelisina 3, una metaloproteasa capaz de degradar un amplio número de proteínas como colágenos IV IX y XI, fibronectina, elastina proteoglicanos y en células estromales inmediatamente adyacentes al tumor epitelial. Sin embargo, no se ha observado correlación entre la expresión de estromelisina 3 y el subtipo histológico de epitelioma basocelular. En el melanoma no se identifica estromelisina 330 . En el carcinoma epidermoide infiltrante se ha detectado estromelisinas (STI y ST2)70.

La expresión del gen del factor de crecimiento de telido conluntivo (CTGF) se estudio mediante hibridación in situ, generalmente en tumores de fi brohistiocitarios y vasculares. Se ha observado que el ARNm de CTGF se expresa en los fibroblastos de dermatofibromas y es negativo en el dermatofibrosarcoma protuberans y en el fibrohistiocitoma maligno. Además, las células endoteliaies en el granuloma piogénico, el angiolipoma y el angioleiomioma expresan ARNm CTGF pero no lo hace el lago venoso ni el angiosarcomal 71.

El receptor del factor de crecimiento del endotelio vascular (VEGFR-3) es un marcador específico de células endoteliales linfáticas. Mediante hibridación in situ este marcador se detecta en los linfáticos de piel normal, en el endotelio de la linfangiomatosis cutánea y apenas se expresa en hemangiomas cutáneo72.

c. Procesos inflamatorios crónicos

La hibridación in situ se ha empleado en la investigación de mecanismos inmunológicos, como el estudio de quemoquinas, por ejemplo, IP-9 (proteína inducible por el interferón gamma-9), cuyo ARNm que se expresa en queratinocitos basales en una serie de trastornos cutáneos como dermatitis de contacto alérgica, liquen plano y micosis fungoides73.

El estudio inmunohistoquímico y de ARNm en biopsias de piel de las moléculas de adhesión indica que en los estadios avanzados de insuficiencia venosa crónica, caracterizados por hiperpigmentación y esclerosis en dermis y tejido celular subcutáneo, que preceden a la ulceración cutánea, la expresión de ICAM-1 (molécula de adhesión intercelular-1) y VCAM-1 (molécula de adhesión celular vascular1) permanece elevada, lo que probablemente haga perdurar el daño tisular a través de la llegada de leucocitos activados que Finalmente conduce a la ulceración de la piel74.


FISH

Se utiliza sondas especificas para determinados cromosomas o secuencias de ellos. Se desnaturaliza el ADN con calor y se incuban las muestras con formamida y tampón o bien son a su vez detectables por un intermediario marcado con fluorescencia. Esto nos permite poner de manifiesto alteraciones cromosómicas (translocaciones, deleciones, monosomías y trisomías). Para utilizar la FISH es necesario que las células se encuentren en metafase o en interfase. Para estudiar pequeñas translocaciones cromosómicas con sondas completas de un determinado cromosoma, la técnica ha de realizarse en metafase con los cromosomas separados para lo cual es necesario disponer de un cultivo celular75.

Es una técnica de gran sensibilidad que puede realizarse con relativa rapidez. El FISH centromérico permite contar exactamente el número de centrómeros presentes en una célula, o valorar varios centrómeros a la vez en cada célula usando zonas de varios colores, además requiere una cantidad de ADN muy pequeña. Las desventajas de esta técnica es que es muy laboriosa, no permite estudiar las muestras varias veces , no puede ser automatizada y es difícil la diferenciación morfológica entre células normales y malignas25.

Se emplea tres tipos de sondas21:

1. Pintado de cromosomas: Es una sonda compuesta por:

a. secuencia específica de un cromosoma, y
b. secuencias compartidas por otros cromosomas. El resultado obtenido es una hibridación uniforme en todo el cromosoma diana.

2. Sondas centroméricas: Se basan en el ADN satélite alfa (a), que son secuencias específicas de cada cromosoma.

3. Sondas de cósmidos: vectores que cionan fragmentos grandes de ADN de eucariotas.

Aplicación en dermatología

Identificación de anomalías cromosómicas en muestras prenatales (numéricas. translocaciones, etc), detección de translocaciones específicas de determinados tipos tumorales o t(9,11) o t(9,22)en leucemias mieloides, altercaciones del cromosoma 12 en los lipomas) o incluso detección de amplificaciones de oncogenes como el neu en los carcinomas de mama o de próstata, o detección de inserción cromosómica de genomas virales.

Se ha detectado la presencia de trisomía 7 en algunos estudios de queratoacantomas, una alteración también descrita en el carcinoma epidermoide de piel76.

Al igual que el estudio de p53 mediante PCR, se ha utilizado FISH para valorar los márgenes de resección de neoplasias. Valorando el número de copias de ciertos cromosomas en células epiteliales descamadas mediante cepillado, puede detectarse células tumorales en márgenes aparentemente libres de tumor en el carcinoma epidermoide de cavidad oral77


REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA (PCR)

Es una técnica introducida en 1985, capaz de generar grandes cantidades de copias de un determinado fragmento de ADN a partir de mínimas cantidades del mismo (amplificación) en pocas horas78.


TÉCNICAS

La PCR se basa en la replicación del ADN por los enzimas denominadas ADN polimerasas (se utiliza la Taq polimerasa porque es termoestable). Estas enzimas producen copias de ADN complementario a partir de una cadena de ADN de cadena simple (tras desnaturalización del ADN mediante calor) pero sólo pueden empezara copiar añadiendo nucleótidos a una cadena de ácidos nucleicos que debe estar previamente acoplada al ADN de cadena simple (el iniciador o "primer").

La técnica consiste en utilizar dos oligonucleótidos de secuencia conocida que se acoplen específicamente a los márgenes de una determinada secuencia que queremos amplificar, después se añade la Taq polimerasa, nucleótidos y MgC 12 (indispensable para la reacción). La Taq polimerasa actuará copiando la secuencia de ADN contenida entre los iniciadores. El proceso se repite múltiples veces mediante la sucesión de ciclos en los que se varía la temperatura de la muestra, así al aumentar la temperatura de la muestra se produce la desnaturalización del ADN de doble cadena. Luego se vuelve a disminuir la temperatura con lo que se produce la hibridación o emparejamiento (annealing) de los oligonucleótidos (primers) con sus secuencias complementarias específicas;tras la hibridación actúa la Taq polimerasa (extensión) Esta secuencia constituye un ciclo, se suceden posteriormente varios ciclos en los que se separa el ADN de doble cadena recién copiado al aumentar el calor y al enfriarse la muestra vuelven a producirse hibridación y extensión de manera que la secuencia de ADN contenida entre los iniciadores se replica de modo exponencial, lo que permite obtener una gran cantidad de copias de la secuencia elegida partiendo de muy escasa cantidad de ADN inicial. En cada ciclo se dobla la cantidad de ADN del ciclo anterior, según la fórmula 2n (donde "n" es el número de ciclos)79,80

En general en una PCR el número de ciclos varía entre 25 y 40 no siendo aconsejable alargar el número de ciclos más allá de 40, puesto que la amplificación sigue un proceso exponencial hasta aproximadamente el vigésimo ciclo para alcanzar después poco a poco una meseta donde no hay más incremento en la producción de ADN80.

La temperatura de hibridación (annealing), el tiempo de cada etapa, el número de ciclos y las condiciones de la reacción son muy variables y se han de adaptar según la naturaleza del ADN a copiar y de los cebadores, la calidad de la Taq polimerasa, el tipo de aparato termociclador (Figura 2), etc. Por ello es necesario desarrollar un protocolo específico para cada una de las secuencias de ADN que deseemos aplicar (por ejemplo, replicar una secuencia de ADN del virus de HPV 18 requiere unas condiciones diferentes que replicar una cadena de ADN de IgH humana y no basta sólo con cambiar los iniciadores específicos80.

Debido a la gran sensibilidad de la técnica uno de los principales problemas es el riesgo de contaminación con ADN extraño y la aparición subsiguiente de amplificaciones no deseadas81.

Los iniciadores o cebadores o "primers" son secuencias de entre 15 Y 30 nucleótidos que se han de hibridar a cada lado de la secuencia a amplificar. En algunos casos se utiliza «cebadores degenerados», es decir mezclas de cebadores que se diferencian en alguna base; esas mezclas se usan para la detección de secuencias conservadas, por ejemplo, entre distintos genotipos de los mismos virus (HPV)22.

La técnica puede ser aplicada a tejidos fijados en formol e incluidos en parafina, aunque es conveniente que los fragmentos de ADN buscados no superen los 300 pares de bases. Otros fijadores como B5 no son adecuados para los estudios de PCR22.

 

Figura 2. Termociclador Gene Amp PCR Systems 9600 (Perkin-Elmer, EE. UU)


ANÁLISIS DEL PRODUCTO DE PCR

El método más frecuente y universal de detección de ADN es la electroforesis en un gel teñido con bromuro de etidio (para permitir la visualización del ADN puesto que esta molécula se inserta entre las bases entre las bases del ADN dando lugar a una alta densidad electrónica) y la visualización del ADN cuando el gel se expone a luz ultravioleta que estimula los electrones en los lugares donde hay depósito de bromuro de etidio provocando autofluorescencia. Las bandas gruesas obtenidas tras la electroforesis del producto de PCR corresponden a las secuencias de ADN que han sido copiadas por la Taq polimerasa y su tamaño es conocido porque en cada electroforesis en uno de los pocillos se añade una mezcla con fragmentos de ADN de tamaños conocidos, así, según la altura a la que caiga la banda conoceremos su tamaño.

Aplicando este método podemos saber si se ha amplificado la cadena de ADN específica. Por ejemplo de HPV frente a la que habíamos diseñado los iniciadores, lo que indicara que esta cadena estaba presente en el ADN de la muestra y por lo tanto existe infección viral. Otros ejemplos de amplificaciones de oncogenes son el N-myc en el neuroblastoma y c-erbB-2 en el carcinoma de mama.

En ocasiones lo que nos interesa no es saber sólo si se amplifica o no una secuencia sino el tamaño de la secuencia que se amplifica. Por ejemplo, en el estudio de clonalidad del tejido linfoide se amplifican secuencias de ADN que siempre están presentes en el tejido linfoide (generalmente las que codifican para IgH o TCR). Lo que nos interesa es saber si las secuencias amplificadas por la PCR tienen todas el mismo tamaño (lo que implicaría monoclonalidad del tejido) o son de tamaños variables (lo que implica policlonalidad). Esto ocurre así debido a la propiedad del tejido linfoide de reordenar su ADN durante su proceso de maduración de forma que en cada clon la longitud del fragmento de ADN que codifica para IgH o TCR es de distinto tamaño. Para poder detectar estas diferencias de longitud en estas secuencias concretas se utiliza cebadores complementarios a regiones relativamente estables (secuencias de consenso) dentro de estas secuencias que flanqueen regiones denominadas hipervariables. Existen sistemas comerciales , basados en fluorescencia (fluorescent fragment analysis) que facilitan estos pasos e incluso incluyen sistemas informáticos que analizan el tamaño de los productos de PCR (GeneScan, Appliad Biosystems, EE.UU.)16.

Aplicación en Dermatología

Es una técnica extraordinariamente útil por su sensibilidad y por requerir muy poco ADN, de forma que puede ser utilizada en tejidos incluidos en parafina 82,83.


AMPLIFICACIÓN DE ADN

Permite replicar fragmentos de ADN con la única condición de que se conozcan al menos dos secuencias génicas entre las cuales se localice el fragmento. Esto permite que tras la extracción de ADN se pueda amplificar el fragmento que nos interesa estudiar y disponer de una gran cantidad de material sobre el que se puede realizar distintos estudios (como técnicas de hibridación, u otras técnicas de las que hablaremos más adelante), como el estudio de mutaciones cromosómicas (ver más adelante). De hecho en la actualidad la práctica totalidad de estos estudios se realizan sobre productos de PCR.

De esta forma, pueden ser detectadas translocaciones, como t(12-16) en el Liposarcoma mixoide, anomalías de genes supresores (Rb o p53), microorganismos: (como micobacteriosis) y se aplica en el estudio de inestabilidad microsatélite.

El ADN puede ser aislado de secciones en parafina con un extractor de ADN automático84.


DETECCIÓN DE INFECCIONES

La simple amplificación de ADN que en condiciones normales no debería encontrarse en tejidos humanos (ADN viral o bacteriano) permite establecer la presencia de infección (Tabla 4).

TABLA 4. Microorganismos detectados mediante técnicas moleculares
Virus Bacterias Hongos Protozoos
Virus herpes simple
Virus varicela-zoster
Virus herpes humano 8
Virus Epstein-Barr
Citomegalovirus
Virus/hepatitis B
VIH 1,2
HTLV I y II
Papilomavirus
Parvovirus
Virus Coxsackie
Rotavirus
Micobacteriosis
(M. tuberculosis y atípicas)
Trypanosoma sp.
Helicobacter sp.
Escherichia sp
Legionella sp
Rickettsia sp
Chlamydia sp
Borrelia sp
Candida sp.
Malasezzia sp
Pitirosporum sp
Neisseria sp
Toxoplasma sp.
Plasmodium
Leishmania sp.
VIH: Virus inmunodeficiencia humana
HTLV: Virus leucemia de células T humano

La identificación directa de bacilos ácido alcohol resistentes en las secciones tisulares, aunque rápida, es de bala sensibilidad, ya que requiere una gran cantidad de microorganismos (104/ML). Además, la tinción directa es inespecífica, ya que no permite diferenciar las distintas especies de micobacterias, lo que resulta de especial importancia en pacientes VIH+62. La amplificación mediante PCR seguida de digestión con enzimas de restricción del producto de PCR es un método rápido (en menos de tres días) y sencillo para la detección y diferenciación entre Mycobacterium tuberculosis y M. avium-intracellulare en esputo, líquido cefalorraquídeo o en tejidos incluidos en parafina, sin necesidad de esperar las 3 a 8 semanas que supone en cultivo del microorganismo62,85 . Algunos de los genes de M. tuberculosis más frecuentemente utilizados son IS6110, una secuencia de inserción repetida entre 1 y 24 veces en las micobacterias del complejo M. tuberculosis, o el gen hsp65, muy conservado entre las distintas especies de micobacterias, que codifica la proteína de choque térmico de 65 kDa62.

Utilizando iniciadores específicos de ARN ribosómico del agente de la angiomatosis bacilar (Rochalimaea henselae), una entidad similar a la verruga peruana o enfermedad de Camón86, mediante PCR se puede identificar secuencias de ADN específicas de este microorganismo87,88. En pacientes con SIDA se describe la presencia simultánea de múltiples agentes infecciosos, como Mycobacterium avium-intracelular en combinación con angiomatosis bacilar89.

En la enfermedad de Lyme, en Europa, se describe al menos tres agentes causantes: Borrelia burgdorferi sensu stricto, B. garinii y B. afzelii. Los estudios mediante PCR con ARN ribosómico 16S ribosomal confirman que B. afzelii es la bacteria más frecuente, pero no el único agente etiológico de la acrodermatitis crónica atrófica90.

La PCR es efectiva en la detección de ácidos nucleicos virales tanto en tejidos frescos como fijados en parafina, y se ha empleado con éxito en infecciones por el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH)91, virus de Epstein-Barr92, citomegalovirus93, subtipos específicos del virus del papiloma humano94 y virus del herpes simple95.

De esta forma, es posible documentar una infección temprana por citomegalovirus en pacientes inmunocomprometidos96, incluyendo los trasplantados de médula ósea y la infección por VIH. Además, las técnicas de PCR son discriminantes en el contexto de resultados "indeterminados" obtenidos en inmunoblots de VIH97.

La PCR es el método detección de HPV más sensible. Existen numerosos sistemas de detección de genotipos HPV basados en PCR y se ha diseñado varios protocolos específicos de genoma, principalmente basados en cebadores seleccionados de las regiones del HPV L1 o El (estos dos marcadores de lectura abierta son los más conservados entre los distintos tipos de HPV), ES, E6 y E7. Una vez detectado el HPV para confirmar la especificidad e identificar los genotipos de HPV se utiliza dot blot, dot blot inverso, Southern blot, análisis de restricción de fragmentos (es el más fácil), secuenciación directa del ADN, amplificación anidada, polimorfismo estructural de cadena sencilla o inmunoensayo enzimático de oligonucleótidos. De todos ellos, los métodos de tipificación genómica más adecuados para un laboratorio general es el inmuno ensayo enzimático con oligonucleótidos con sondas específicas de cada genoma, aplicado a los productos de amplificación de PCR, una técnica que puede ser automatizada en su totalidad y cuyos resultados pueden ser valorados en un espectrofotómetro en menos de 6 horas22.

En el caso de biopsias de pequeño tamaño, puede ser difícil distinguir un carcinoma verrucoso de una verruga vulgar Las técnicas inmunohistoquímicas apoyan el diagnóstico de verruga si se detecta la proteína del virus en el núcleo de los queratinocitos. La amplificación del ADN viral mediante PCR proporciona el método más sensible para la detección del papilomavirus.

También se emplea PCR en el diagnóstico de numerosos hongos98 y en el estudio de hongos como Malassezia furfur en la dermatitis atópica99.

La elección entre técnicas de cultivo convencionales y análisis moleculares vendrá determinado en parte por el entorno diagnóstico y clínico en que nos encontremos. La rapidez y sensibilidad que ofrecen los análisis con sondas moleculares tiene su contrapartida en su capacidad de detección de un único microorganismo en cada prueba (aunque también pueden utilizarse múltiples iniciadores o sondas) y por no poder ser aplicados a pruebas de sensibilidad microbiana.


APLICACIONES EN NEOPLASIAS

La metodología en la que se basa ha permitido el desarrollo de nuevas estrategias moleculares (análisis de fragmentos de restricción, detección de clonalidad en tejido linfoide, etc.)100. Permite detectar células tumorales en sangre periférica (por ejemplo, antígeno específico prostático en el carcinoma de próstata) o recidivas de leucemia mieloide crónica tras trasplante de médula ósea101.

Reordenamientos clonales. Linfomas

En lesiones con un importante componente linfoide no neoplásico, como la dermatitis actínica crónica o reticuloide actínico, el principal diagnóstico diferencial es el linfoma cutáneo de células T La inmunohistoquímica puede ayudar en ocasiones, pues el infiltrado es predominantemente CD8 positivo. Sin embargo, sólo podemos descartar con mayor seguridad un linfoma T si realizamos el estudio del patrón de reordenamiento del gen del antígeno del receptor de células102.

Micosis fungoides

Los estudios del reordenamiento genético del gen del receptor B de células T y demuestran que la micosis fungoides es una proliferación clonal de células T 103 . Las diferentes localizaciones de la enfermedad en el mismo paciente generalmente muestran idénticas bandas clonales, indicando que la enfermedad es monoclonal y sistémica en los pacientes con lesiones múltiples. El reordenamiento clonal del gen del receptor B de células T también se encuentra en la reticulosis pagetoide y la enfermedad de la piel laxa granulomatosal04.

Los estudios de reordenamiento genético han demostrado ser de gran utilidad en el diagnóstico de la afectación ganglionar mínima por micosis fungoides y para el diagnóstico de afectación sanguínea104. En un 57% de pacientes con micosis fungoides (incluso en estadios precoces), en un 85% de síndrome de Sézary y en un 77% de linfomas cutáneos T pleomórficos, se identifican células T tumorales en sangre circulante mediante PCR105

Aunque estos estudios podrían ser de ayuda en el diagnóstico inicial de la micosis fungoides y sobretodo del síndrome de Sézary mediante el análisis de linfocitos sanguíneos periféricos, hay que recordar que los reordenamientos clonales del gen del receptor B de células T ocasionalmente aparece en el ADN de linfocitos periféricos sanguíneos de pacientes sin neoplasias linfoides, como en la mononucleosis infecciosa aguda o en biopsias de piel de papulosis linfomatoide y en la pitiriasis liquenoide y varioliforme aguda (enfermedad de Mucha-Habermann). Adicionalmente, conviene recordar que se describe pseud omonoclonalidad en algunos casos de psoriasis y eccema, debida a la alta sensibilidad de estas técnicas que detectan clonas de células T dominantes (pero no realmente clonales) en estos procesos inflamatorios. Por lo tanto, es necesario realizar análisis repetidos de los casos monoclonales para confirmar la monoclonalidad de los productos de PCR16.

Los estudios de reordenamiento genético pueden utilizarse también en el diagnóstico de micosis fungoides inicial en las biopsias de piel, puesto que casi todas las dermatosis inflamatorias muestran una configuración de línea germinal para el receptor B de células T104

Estudiando mediante PCR el gen del receptor TCR-gamma, se demuestra monoclonalidad en un 60% a 72% de los casos de micosis fungoides105. Por lo tanto, su utilización para el diagnóstico diferencial entre linfoma cutáneo o infiltrados de células T reactivas es limitado.

En la mayoría de los pacientes con micosis fungoides, se encuentran anomalías citogenéticas en las células analizadas de las biopsias en las que la afectación por la neoplasia es sospechada, incluso en sitios en los que la afectación no puede ser probada morfológicamente. En contraste con muchos otros linfomas, no se detectan anomalías citogenéticas constantes en la micosis fungoides. Los estudios de bandeo de cromosomas muestran extensa heteroploidía. En un estudio se demostró anomalías numéricas de los cromosomas 11, 21 y 22, mientras que las anomalías estructurales eran más frecuentes en el cromosoma 1. Los pacientes con cambios cromosómicos más extensos tienden a tener una enfermedad clínica más avanzada. La formación clonal se asocia a un peor pronóstico. Los estudios citofotométricos de ADN también muestran una población de ADN aneuploide en los tejidos afectados de micosis fungoides106.

Linfoma anaplásico de célula grande CD30+

Aunque los tumores de células-T con frecuencia muestran reordenamientos de los genes del receptor de células-T (TCR) (50 a 60%) y los tumores de células B reordenamientos para los genes de inmunoglobulinas, algunos linfomas anaplásicos de célula grande carecen de reordenamientos en ninguno de los genes, muestran reordenamientos en ambos tipos de genes, o muestran una discrepancia entre inmunofenotipo y genotipo. La ausencia de reordenamiento del TCR no descarta un origen en células T104.

Una anomalía cromosómica característica detectada en algunos casos de origen en célula T o indefinida es translocación t(2;5) (p23;q35). La frecuencia de t(2;5) es de un 12% en las series de adultos y un 50% en las series de niños o adultos jóvenes. En el linfoma primario cutáneo de célula grande CD30+ sólo ocasionalmente se identifica t(2.5)104

Aunque la inmunorreactividad frente a la proteína p53 se detecta en el 80% de los linfomas anaplásicos de célula grande, son raras (6%) las alteraciones estructurales del gen p53. Las anomalías del gen c-myc: (mutación, translocación o amplificación) se detecta en un 32% de los casos, y los casos positivos frecuentemente son de línea B. Por otra parte los genes bcl-2, K-ras, N-ras y H-ras no están estructuralmente alterados104.

Todos los linfomas anaplásicos de células T primarios cutáneos expresan el gen "homeobox" C5 (H0XC5). También se ha descrito la presencia de secuencias provirales de HTLV-1 en linfomas anaplásicos de célula grande CD30+ cutáneos en áreas no endémicas104.

En los pacientes VIH positivos, los linfomas cutáneos frecuentemente son linfomas de células T tipo células grandes CD30+, y en estos se identifica el virus de Epstein-Barr en un 73%107.

Linfoma/leucemia de células T del adulto

Con frecuencia afecta a la piel, donde puede recordar una micosis fungoides (son frecuentes los microabscesos de Pautrier) o un linfoma anaplásico de célula grande Ki-1+. Se identifica reordenamiento clonal de los genes de los TCR y se detecta el genoma del virus HTLV (human T-cell lymphotropic virus)-1 integrado en todos los casos (66 108).

La infección por HTLV-1 se ha asociado, asimismo, a varias entidades no neoplásicas, como trastornos neurodegenerativos crónicos, mielopatía (paraparesia espástica tropical) y uveítis y dermatitis infecciosa en niños109

Linfoma de células T tipo linfadenopatía angioinmunoblástica (AILD)

Su diagnóstico diferencial incluye la micosis fungoides cuando infiltra la piel. Muestra reordenamiento clonal de genes TCR en el 75%, y de IgH en un 10%. Puede identificarse trisomía 3 y/o 5. Es el segundo linfoma T periférico que se asocia con mayor frecuencia (50%) al virus de Epstein-Barr (VEB), después del linfoma nasal T/NK. Se identifica ambos subtipos 1 y 2, del VEB, a veces en el mismo caso. Con hibridación in situ el VEB se identifica sólo en 5-20% de células T neoplásicas, observándose una mayor positividad en las células B reactivas104.

Linfomas angiocéntricos cutáneos primarios

A diferencia de los linfomas angiocéntricos de células NK/T, que afectan al tracto respiratorio superior con o sin afectación cutánea secundaria, los linfomas angiocéntricos cutáneos primarios generalmente tienen un fenotipo de célula T CD3+, CD4+ y rara vez expresan CD8 ó CD56. Es rara la asociación con virus Epstein-Barr y tienen un pronóstico más favorable. clínicamente no se diferencian significativamente de otros linfomas de células-T cutáneos puede mostrar angiocentricidad104,

Sarcoma de Kaposi

Los estudios citogenéticos basados en el receptor de andrógenos (un locus polimórfico ligado al cromosoma X) en el sarcoma de Kaposi de la piel, demuestran que esta lesión es clonal 110, y el estudio con PCR usando técnicas de microdisección demuestra que la infección por el virus del herpes humano 8 (VHH8) es específica de las lesiones cutáneas de Sarcoma de Kaposi y no se identifica en el tejido normal adyacente111. El estudio de células mononucleares en sangre periférica mediante PCR en pacientes VIH positivos demuestra que el VHH8 aparece en un 52% de pacientes VIH positivos que han desarrollado un sarcoma de Kaposi, mientras que este virus sólo está presente en un 8% de pacientes que no tienen sarcoma de Kaposi. Sin embargo, en éste último grupo, más de la mitad(54,5%) de los pacientes con VHH8 desarrollaron posteriormente el sarcoma de Kaposi, frente a un 9,1 % de los pacientes en los que no se detectó VHH8 en sangre periférica 112.

El análisis del virus HH8 es útil en el diagnóstico diferencial el sarcoma de Kaposi (clásico o asociado a SIDA) con otras entidades como el hemangioendotelioma fusocelular hemangioendoteliomakaposiforme, angiosarcoma, hemangiomas y tumores glómicos. Se ha descrito reacción positiva para VHH8 en 1 de 20 granulomas piogénicos estudiados 113.

Estudio de p53

El producto del gen supresor de tumor p53 es una proteína que se une al ADN y la pérdida o mutación de p53 tiene un papel fundamental en la carcinogénesis. El gen p53 humano está localizado en el cromosoma 17 (17p13). la proteína p53 es un elemento esencial en procesos celulares fundamentales, incluyendo la transcripción de genes, reparación de daño en el ADN, control del ciclo celular, estabilidad genómica, separación cromosómica, senescencia y apoptosis114.

Se ha descrito 3 tipos de alteraciones genéticas de la función de la proteína p53: (i) Deleción parcial o total del gen, que anula la función de supresión tumoral y contribuye al desarrollo de tumores (ii). Un efecto negativo dominante en algunas mutaciones críticas que suprimen la función de la proteína p53 salvaje al inhibir la actividad de unión al ADN y por lo tanto su función transactivadora. (iii). Ciertas mutaciones de p53 (como la proteína 175His p53) que parecen tener su función aumentada, se asocian a un aumento del potencial cancerígeno y metastásico3.

El patrón de mutación del gen p53 puede ser utilizado como marcador diagnóstico de carcinomas múltiples primarios y secundarios, y así facilita la distinción entre múltiples carcinomas primarios o la existencia de metástasis115. Las mutaciones adquiridas de p53 constituyen el defecto genético aislado más frecuente en tumores (presente en más del 50%)116. Se ha identificado y clasificado más de 5,000 mutaciones, disponibles en bases de datos accesibles a través de redes informáticas117. Las mutaciones producidas por rayos UV son tan características que se denominan mutaciones con la «Firma» UV Las mutaciones detectadas en los tumores cutáneos que aparecen en el xeroderma pigmentoso ocurren en el segmento no transcrito lo que implica una reparación preferencial de las lesiones por UV en el segmento transcrito en tejidos humanos3.

Varios estudios de alteraciones de p53 a nivel genético implican a agentes ambientales específicos, como la radiación ultravioleta, en la etiología del cáncer de piel118.

La radiación ultravioieta B (290-320 nm) induce mutaciones en p53 a través del daño en el ADN, que han sido detectadas tanto en el carcinoma epidermoide como en el queratoacantoma119. A diferencia del carcinoma de colon, en el que la mutación de p53 es un hecho tardío, la mutación de p53 parece ser un evento precoz en el desarrollo de queratosis actínica, carcinoma epidermoide y epitelioma basocelular120-25

Las mutaciones de p53 se encuentran más frecuentemente en carcinomas epidermoides infiltrantes (90%) y epiteliomas basocelulares (56%) que en el carcinoma in situ (enfermedad de Bowen) o microinfiLtrante 126, 127.

Se ha encontrado correlación entre la frecuencia de mutaciones de p53 en biopsias de piel normal expuesta a rayos ultravioleta y el riesgo de desarrollo posterior de epitelioma basocelularl28.

En los pacientes con xeroderma pigmentoso grupo C la frecuencia de mutaciones de p53 en sus tumores cutáneos es mucho más alta (85%) que en los pacientes de xeroderma pigmentoso que no pertenecen a ese grupo (33%) 129 .

Además de la radiación ultravioleta, hay otros factores involucrados en la etiología del carcinoma epidermoide de piel y el queratoacantoma, como la exposición a hidrocarburos y la infección por HPV como lo demuestra la mayor incidencia de estos tumores en el contexto de infección por HPV en enfermos trasplantados con inmunosupresión. Las similitudes encontradas a nivel molecular han llevado a muchos autores a concluir que el queratoacantoma podría ser considerado una variante del carcinoma epidermoide bien diferenciado119.

En el cáncer de piel relacionado con arsénico, el porcentaje de mutaciones del gen p5 es alto (39% en enfermedad de Bowen y 56% en carcinoma epidermoide), excepto en el epitelioma basocelular (29%) y las mutaciones son diferentes a las observadas en la radiación UV130.

En algunos tumores (carcinoma de próstata o de mama), la presencia de mutación de p53 se asocia a un peor pronóstico131,

Las mutaciones en p53 pueden estar situadas en la línea germinal (síndrome Li Fraumeni), confiriendo un riesgo significativamente alto de múltiples tipos de cáncer primarios en los portadores de esta mutación 132,133.

La mayoría de queratoacantomas expresan p53 mutante, lo cual no contradice la posibilidad de regresión tumoral de esta lesión, un hecho mediando por mecanismos inmunológicos, sobreexpresión de oncogenes H-ras, cmyc e, incluso, p53 salvaje119.

La presencia de mutaciones en p53 también puede ser utilizada en la valoración de márgenes en la extirpación de neoplasias ("márgenes moleculares"), pues la valoración molecular de p53 permite afinar aún más en la predicción de las recurrencias locales del tumor134, aunque algunos estudios inmunohistoquímicos no confirman estos hallazgos135.

En las lesiones premalignas de los genitales masculinos no parece existir relación entre la expresión proteica de p53 y la infección por el HPV; en esta localización p53 podría no participar en los estadios iniciales de la carcinogénesis 136.

Mientras que el estudio genético de p53 basado en biología molecular del ADN permite detectar casi todos los tipos de mutaciones, la información morfológica se pierde (excepto cuando se realiza PCR in situ) y la técnica es susceptible de contaminación por células epiteliales benignas, estromales o inflamatorias que se encuentran presentes en la muestra, sobre todo cuando éstas se seleccionan durante el examen macroscópico 137.

Otro gen supresor de tumor, p16 (MTSI) también se encuentra mutado o delecionado en un amplio espectro de tumores malignos138, entre los que destacan las pequeñas deleciones homocigotas en el melanoma y el carcinoma epidermoide. Además, el p16 está frecuentemente inactivado en las lesiones premalignas139.

El p21 WAFI es un gen supresor, que codifica un inhibidor de la quinasa dependiente de ciclina relacionada con p53, que relacionado con los estadios iniciales de la aparición de palpilomas cutáneos, pero no parece jugar un papel significativo en la progresión maligna140

En el dermatofibrosarcoma protuberans, hay evidencias que sugieren que las alteraciones en la vía de la p53, como la sobreexpresión de p53 por un gen mutado y la sobreexpresión de mdm2, una proteína relacionada con p53, participan en la transformación fibrosarcomatosa y en un comportamiento más agresivo localmente141.

Se describe también mutaciones de p53 en un 21 % de los melanomas, asociadas con la exposición a UV aunque en estos tumores es posible que estas mutaciones sean un fenómeno tardío y no participe en la génesis del tumor 142.

Las mutaciones de p53 observadas en algunos linfomas cutáneos primarios parecen indicar que también en estos tumores la radiación ultravioleta podría participar en la oncogénesis de estos tumores y en la progresión de la micosis fungoides de estadio placa a estadio tumor143, pero no parece intervenir en la transformación de la micosis fungoides/síndrome de Sézary en linfoma de célula grande144.


Gen hptc (patched)

El gen humano hptc es homólogo al gen ptc (patched) de la Drosophila (gen parcheado de la polaridad de segmento), otro gen supresor tumoral que controla la actividad de crecimiento y diferenciación. Su función es opuesta al gen erizo sónico (Sonic hedgehog, Shh) que expresa una proteína de señalización que induce el crecimiento celular y la diferenciación3. En la transducción de la señal ptc participa otro gen similar al descrito en la Drosophila llamado smoothned (vSmo) que codifica una proteína de membrana con características de receptorG. La proteína ptc forma un complelo con vSmo y serviría de receptor para Shh en el mecanismo de señalización celular145.

El gen ptc humano se localiza en el cromosoma 9q22,3, en el mismo lugar que se ha localizado el síndrome del epitelioma basocelular nevoide o síndrome de Gorlin, un trastorno autosómico dominante caracterizado por múltiples epiteliomas basocelulares que aparecen a partir de la segunda década de la vida, sobre todo en piel expuesta al sol. Esta enfermedad también incluye trastornos del desarrollo (alteraciones faciales, en costillas, y a veces polidactilia y sindactilia y espina bífida), fibromas de ovario y de corazón, quistes cutáneos y mandibulares y, en sistema nervioso central, meduloblastomas y meningiomas3. Los pacientes con síndrome de Gorlin tienen mutaciones genómicas y esporádicas en el gen ptc. lo que sugiere que estas mutaciones son la causa última de esta enfermedad146.

La alteración en la regulación del mecanismo de señales de prc, posiblemente relacionada con mutaciones originadas por la radiación por UV-B, es una característica general de los epiteliomas basocelulares, tanto esporádicos como familiares, como lo demuestran los estudios de hibridación in situ, que muestran una sobreexpresión de ARNm de ptc147.

También se ha descrito la mutación del gen humano Shh o de otros genes Hh en el epitelioma basocelularl48.

El gen ESS 1 (epitelioma escamoso múltiple autocurativo), localizado en el cromosoma 9q.31 parece participar también en la inducción del carcinoma epidermoide de piel 149.

Familia ras

Los protooncogenes H-ras, K-ras, y N-ras codifican proteínas de 21 kDa que comparten un 70% de secuencia homólogal50. Están localizados en la cara interna de la membrana celular y participan en la transmisión de señales uniéndose a GTP Las mutaciones que activan los genes ras son menos frecuentes en La piel humana que las mutaciones del gen p53, identificándose en un 22% de casos de cáncer de piel151. Sin embargo, en el cáncer de piel que aparece en los pacientes con xeroderma pigmentoso se identifica con mayor frecuencia (53%) de mutaciones de genes ras.

Los modelos experimentales demuestran la existencia de mutaciones en genes ras en cáncer de piel inducido por radiación UVIII.
Las mutaciones ras son también más frecuentes en los melanomas asociados a exposición solar

Genes GADD (parada en la maduración por daño en ADN)

Los nevus melanocíticos son muy positivos para los genes GDA y suelen ser negativos para p53, excepto los nevus displásicos que muestran mayor expresión de p53 y menos expresión de GADD34 y GADD 153153.

bcl-2

En el epitelioma basocelular se ha detectado un marcado incremento en la expresión de la proteína bcl-2, que podría incrementar el número de células proliferantes al inhibir la apoptosis54.

En el queratoacantoma, la apoptosis representa un mecanismo clave en la regresión, demostrado mediante una escasa expresión de bc1-2154, un oncogén que evita que las células entren en apoptosis frente a una fuerte expresión del antígeno sanguíneo relacionado con la apoptosis Le(Y)155.

El gen bcl-2 está activado en algunos linfomas B, pero no en el linfocitoma cutis benigno54.

Moléculas de adhesión

La expresión de E-caderina está reducida focalmente en el epitelioma basocelular, lo que podría contribuir a las anomalías de la superficie celular asociadas con la invasión e infiltración del tumor156

El bajo potencial metastásico de los queratoacantomas se correlaciona con la fuerte expresión de vinculina, una proteína de la unión tipo adherens junction también relacionada con su escasa capacidad infiltrante157, y el gen supresor de metástasis nm23158

Anomalías cromosómicas

En los linfomas, la presencia de translocaciones puede ser analizada incluso en tejidos incluidos en parafina, lo que permite el estudio enfermedad mínima residual y la distinción entre recurrencias y los nuevos tumores159.

ENFERMEDADES HEREDITARIAS

La PCR es muy útil en las enfermedades originadas por mutaciones puntuales.

Se ha descrito más de 20 mutaciones en el gen asociado a la fibrosis quística (el regulador de conductividad transmembrana de la fibrosis quística). Sin embargo, la anomalía más frecuente, presente en el 80% de los portadores, es la deleción de 3 pares de bases que originan la pérdida de un único aminoácido de fenilalanina en la posición 508 (Delta-F508). La detección de esta alteración fácil utilizando preamplificación de la secuencia lindante mediante PCR, que incluso puede ser automatizada 160.

Sin embargo, en algunas familias, en las que la naturaleza exacta del defecto es desconocida, linkage analysis es necesario, a pesar de sus limitaciones.

En el caso de enfermedades atribuibles a defectos en múltiples genes, su demostración es más difícil. Por ejemplo, en la enfermedad vascular coronaria, las mutaciones en los genes del receptor de LDL y de ApoB, así como los polimorfismos de los loci ApoE y Apo(a) pueden contribuir conjuntamente al riesgo161.

En el xeroderma pigmentoso, un término que incluye varias enfermedades distintas, todas ellas caracterizadas por un defecto en la reparación del daño en el ADN inducido por radiación ultravioleta162, el daño por rayos ultravioleta afecta a muchos genes y cromosomas. Uno de ellos es el oncogén N-ras, cuyo codón 6l es sensible a la radiación ultravioleta. Esta forma mutada del gen es capaz de producir tumores163. también el gen supresor p53, amba mencionadojuega un importante papel en la aparición de carcinomas epidermoides en esta enfermedad. El gen del xeroderma pigmentoso A se localiza en 9q22,3, la misma región (9q22,3-q31) que el gen del síndrome de epitelioma basocelular nevoide (NBCCS)118.

En la eritroqueratodermias (como la queratodermia palmoplantar o la eritroqueratodermia simétrica progresiva) se ha detectado mutaciones en el gen loricrina 164.

El análisis de mutaciones en el ADN mitocondrial mediante PCR parece ser un marcador útil de la exposición acumulada a rayos ultravioleta, y se ha utilizado como marcador de la relación entre la edad cronológica y "foto-edad" de la piel. Al parecer las mutaciones aparecen más en dermis (fibroblastos) que en epidermis, lo que concuerda que la ausencia de estas mutaciones en tumores epidérmicos165.

Las alteraciones del ADN mitocondrial también puede conllevar anomalías en el pelo y erupciones cutáneas pigmentadas, como se ha demostrado en pacientes con trastornos mitocondriales166.

TABLA 5. Alteraciones cromosómicas en el albinismo
Tipo de albinismo Locus proteina codificada Cromosoma
OCA tipo 1 TYR Tirosina 11q21
OCA tipo 2 F proteína rosa 15q11,2-q12
OCA tipo 3 TYRP1   9p23
Síndrome de Hermansky-Pudlak HPS1

ADTB3A

Proteína de membrana
Subunidad beta-3 del complejo proteína adaptadora(AP-3)
1-q24

T3qT3

Síndrome de Chedlak-Higashi CHST Proteína de memoria Tq43
Albinismo ocular tipo 1 OAI Proteína de membrana Xp22.3
OCA= Albinismo oculocutáneo

En el edema angioneurótico hereditario es una enfermedad autosómica dominante causada por mutaciones que reducen la producción de inhibidor de el funcionante, y que conlleva a la producción de bradiquinina y subsiguiente edema de superficies cutáneas y mucosas. En el cribado de mutaciones para detectar esta enfermedad se ha observado que participan secuencias del genoma sensibles a errores de replicación, denominadas repeticiones invertidas imperfectas (cuasi-palíndromo)167.

El albinismo ha sido extensamente estudiado y se conoce la existencia de múltiples mutaciones en cada una de sus variantes. La Tabla 5 recoge algunos de los genes implicados en estos síndromes168.

ENFERMEDADES AUTOINMUNES

La tipificación HLA también es muy útil para detectar alelos específicos de loci HLA clase II asociados a enfermedades autoinmunes severasl.

En haplotipo ancestral 8,1 (HLA?A1, C7, B8, C4AQ0, C4B1, DR3, DQ2) se asocia a un síndrome de inmunodeficiencia adquirida acelerada por el VIH, susceptibilidad a diabetes insulinodependiente, lupus eritematoso sistémico, dermatitis herpetiforme, inmunodeficiencia común variable, deficiencia de IgA, miastenia gravis y otras entidades. Los genes de susceptibilidad para VIH, diabetes insulinodependiente y miastenia gravis se han localizado en la porción central del Complejo Mayor de Histocompatibilidad (MHC), entre los genes del HLA?B y el factor de necrosis tumoral o los del complemento169.

En las enfermedades cutáneas con formación de vesiculas subepidérmicas los cambios histopatológicos son muy similares entre ellas, por lo que es necesaria la utilización de técnicas específicas para un diagnóstico más específico. La alteración en los componentes de la membrana basal, que origina una pérdida entre la adherencia de la epidermis y la dermis, puede ser debida a mutaciones genéticas o a un ataque por autoanticuerpos. Algunos de los antígenos de la membrana basal que son la diana de reacciones autoinmunes son los antígenos del penfigoide ampolloso localizados en la porción superior de la lámina lúcida/hemidesmosoma (BP230 ó BPAgl y BP 180 ó BP Ag2 o colágeno tipo XVII), habiéndose descubierto también autoanticuerpos frente a diferentes epitopos de BPAg1 en la dermatosis ampollosa IgA lineal11.

CONTINÚA | VER BIBLIOGRAFÍA


Regresar