SISTEMA MITOCONDRIAL ANIMAL (SISMIT): UN PROGRAMA DE COMPUTACIÓN
APLICADO EN EL ANÁLISIS MOLECULAR DE LOS GENOMAS
MITOCONDRIALES DE ANIMALES VERTEBRADOS

(Continuación)

Dentro de esta opción y al seleccionarse un gen que codifique para una proteína se obtendrá su secuencia de aminoácidos respectiva (Fig. 7). También dentro de esta opción se puede realizar comparaciones de dos genes iguales o dos genes diferentes para dos especies diferentes o para la misma especie seleccionada por el usuario (Fig. 8).

Fig. 7: La pantalla muestra la secuencia de los 318 aminoácidos codificados por una sola letra del gen ND1 mitocondrial.

La opción Técnicas Moleculares permite trabajar con las técnicas moleculares más utilizadas en la biología molecular como son el RFLP y PCR (Maniatis, F. & Sambrook, J., 1989). Dentro de la opción RFLP, se puede seleccionar de una lista de 150 enzimas de restricción diferentes, nueve enzimas de restricción y realizar digestiones simples o dobles del mtDNA escogido (Fig. 9). De la misma manera, para la opción PCR, se puede seleccionar dos sondas o primers ya probados a nivel mundial para amplificar una secuencia específica para un mtDNA seleccionado (Fig. 10).

Fig. 9: Banco de datos de las enzimas de restricción utilizadas en RFLP.

Fig. 10: Banco de datos de las sondas utilizadas en PCR.

Para las opciones RFLP y PCR, el programa proyecta un patrón electroforético digital que permite ver al usuario los fragmentos obtenidos por RFLP o el fragmento amplificado por PCR. Además, se puede seleccionar un marcador molecular utilizado comúnmente en los laboratorios para comparar la distancia de migración de la corrida electroforética. Dentro de esta opción se puede obtener información molecular como son el peso molecular (en pb) y el número de los fragmentos digeridos por RFLP (Fig. 11), o el tamaño del segmento amplificado por PCR (Fig. 12).

Fig. 11: En la pantalla superior derecha se indica las enzimas de restricción y marcador seleccionados, y el número de bandas.

Fig. 12: En la pantalla superior derecha se indica las sondas y marcador seleccionados, número de bandas, banda seleccionada y peso molecular en pb.

DISCUSIÓN

El presente reporte demuestra que con nuestro programa SISMIT Animal es posible integrar la información de la secuencia nucleotídica del DNA mitocondrial disponible en Internet de diferentes especies animales con la información de biología molecular utilizados en los laboratorios que analizan esta molécula. De esta manera, se pudo diseñar un programa de computación que utiliza un lenguaje informático para proyectar un sistema de análisis de imágenes y facilitar el acceso y utilización de esta información de una forma fácil, confiable y útil para los investigadores.



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